More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3503 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13488  hypothetical protein  43.83 
 
 
178 aa  154  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  32.67 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  31.78 
 
 
455 aa  73.9  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  34.78 
 
 
466 aa  72.8  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2453  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.16 
 
 
557 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0273  Redoxin domain protein  31.58 
 
 
379 aa  71.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  32.26 
 
 
453 aa  70.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1863  Redoxin domain protein  30.25 
 
 
409 aa  70.5  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  30.61 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  30.61 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  31.03 
 
 
278 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  31.03 
 
 
278 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  28.77 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  22.84 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  25.95 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
484 aa  64.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0780  Redoxin domain protein  30.37 
 
 
471 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  26.4 
 
 
278 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 
278 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.35 
 
 
223 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  28.33 
 
 
278 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  25.23 
 
 
269 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
331 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
269 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  27.41 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  26.32 
 
 
269 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
269 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  24.05 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  31.82 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  30.3 
 
 
248 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  27.35 
 
 
278 aa  58.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  23.23 
 
 
278 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  27.27 
 
 
196 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  25.58 
 
 
267 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  26.53 
 
 
290 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  25.51 
 
 
269 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3149  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.26 
 
 
504 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
342 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4031  Redoxin domain protein  29.67 
 
 
376 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  22.88 
 
 
268 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  29.82 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0908  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.31 
 
 
405 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000924853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  27.64 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  25.83 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7128  hypothetical protein  29.2 
 
 
369 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  30.43 
 
 
232 aa  55.8  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  24.32 
 
 
279 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  23.62 
 
 
276 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0345  redoxin domain-containing protein  29.46 
 
 
211 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.84 
 
 
650 aa  54.7  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  25.2 
 
 
173 aa  54.7  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  25.95 
 
 
190 aa  54.3  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.03 
 
 
381 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06420  Thiol:disulfide interchange protein tlpA  29.46 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  23.6 
 
 
269 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.27 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  27.22 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1730  Redoxin domain-containing protein  21.68 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.686612  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25.95 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.33 
 
 
655 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.54 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
380 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  26.81 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.27 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  26.73 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  32.43 
 
 
332 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  25.78 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.15 
 
 
189 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  24.24 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  26.52 
 
 
205 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.94 
 
 
424 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  25.69 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  24.42 
 
 
174 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.13 
 
 
202 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  29.03 
 
 
306 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  28.33 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  30.58 
 
 
211 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.81 
 
 
173 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  29.84 
 
 
179 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  29.17 
 
 
193 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  23.66 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  30.33 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  25.45 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  30.33 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  30.33 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1552  Redoxin domain protein  26.15 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  30.33 
 
 
186 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2042  thioredoxin family protein  28.85 
 
 
336 aa  51.2  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000137464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  30.33 
 
 
202 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  30.33 
 
 
186 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  30.33 
 
 
186 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2353  Redoxin domain protein  30.99 
 
 
189 aa  51.2  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.485374 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  33.33 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>