More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1552 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1552  Redoxin domain protein  100 
 
 		 174 aa  356  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  37.01 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  31.82 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  48.08 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  30.15 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  28.24 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  28.47 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  27.53 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  25.71 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  36.84 
 
 		 224 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  28.12 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  34.81 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3163  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.01 
 
 		 457 aa  60.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  33.04 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  27.71 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1863  Redoxin domain protein  32.38 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  31.36 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.73 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  34.74 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  34.18 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  27.48 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0596  Redoxin domain protein  28.68 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  33.87 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0676  Redoxin domain protein  29.94 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3498  thioredoxin  31.36 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.84 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  31.58 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  25.95 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.08 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  33.68 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  32.26 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25.81 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  31.36 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  31.36 
 
 		 186 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  27.34 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  31.58 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  27.05 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  31.58 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  30.84 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  27.97 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  31.58 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.51 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  31.3 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  31.58 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  23.16 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  33.68 
 
 		 229 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  32.26 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  30.19 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  32.26 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  31.13 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2353  Redoxin domain protein  25.55 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.485374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0011  hypothetical protein  24.65 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  29.55 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1226  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 		 679 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.15 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.370556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  32.5 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  27.21 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  28.81 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  27.5 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  30.19 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 		 715 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  30.19 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0204  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  28.57 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  29.51 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  29.23 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  28.3 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.36 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.36 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  27.21 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  30.84 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  23.16 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  26.4 
 
 		 453 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  33.05 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.84 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  29.01 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.48 
 
 		 382 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  31.03 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  25.76 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.47 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  27.81 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0011  hypothetical protein  23.24 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  31.62 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0209  periplasmic protein thiol  28.68 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0534506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.6 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  36.07 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  26.89 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.1 
 
 		 445 aa  54.3  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.36 
 
 		 484 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.81 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.95 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  34.25 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  25.66 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  29.7 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  34.25 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>