More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2353 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2353  Redoxin domain protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.485374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3163  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.71 
 
 
457 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.67 
 
 
461 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3987  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.09 
 
 
436 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1076  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.74 
 
 
420 aa  84.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  hitchhiker  0.00953303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0951  Redoxin domain protein  32.88 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00020218  normal  0.975118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
501 aa  82  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283747  hitchhiker  0.000202684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 
650 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  29.24 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.08 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  29.24 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  56.52 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  56.52 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  56.52 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  56.52 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  29.24 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  29.24 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  29.24 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  29.24 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.65 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2856  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.76 
 
 
430 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.400703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  29.24 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  29.87 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  26.39 
 
 
199 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.47 
 
 
173 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  28.08 
 
 
211 aa  61.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.01 
 
 
655 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  31.47 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  31.47 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  31.13 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  41.89 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  41.03 
 
 
433 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.1 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  26.87 
 
 
329 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  30.46 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  30.46 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.63 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  36.63 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  26.9 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  30.46 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.33 
 
 
342 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  29.1 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  30.46 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.33 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  39.24 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  46.3 
 
 
223 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  29.41 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  35.29 
 
 
170 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  29.68 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  47.27 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  26.9 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.17 
 
 
191 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  29.41 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  29.91 
 
 
167 aa  58.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  31.58 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  30.21 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  46.81 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  30.21 
 
 
183 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  36.07 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  28.76 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.1 
 
 
487 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1378  Redoxin domain protein  28.24 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.677919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1552  Redoxin domain protein  25.55 
 
 
174 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169218  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  25.66 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  35.29 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  27.33 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3457  hypothetical protein  30.12 
 
 
167 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  30.08 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  35.64 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  29.47 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  43.75 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  35.53 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  35.29 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  43.75 
 
 
160 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  29.17 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  26.8 
 
 
195 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  43.75 
 
 
160 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  34.34 
 
 
201 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
455 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  31.03 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  38.16 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.45 
 
 
173 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  34.34 
 
 
194 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  26.92 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.22 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.13 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.76 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  33.33 
 
 
196 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>