208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2856 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2856  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
430 aa  889    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.400703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.08 
 
 
461 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3987  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.22 
 
 
436 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1076  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.33 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  hitchhiker  0.00953303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0951  Redoxin domain protein  21.3 
 
 
449 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00020218  normal  0.975118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.88 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3163  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.73 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2353  Redoxin domain protein  28.76 
 
 
189 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.485374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.17 
 
 
183 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.88 
 
 
501 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.283747  hitchhiker  0.000202684 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.54 
 
 
171 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  28.79 
 
 
199 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  26.12 
 
 
191 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  40.38 
 
 
180 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0915  redoxin domain-containing protein  28.81 
 
 
158 aa  53.9  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  30.56 
 
 
169 aa  53.5  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.09 
 
 
170 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.56 
 
 
191 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  25.4 
 
 
581 aa  53.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  25.37 
 
 
191 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  26.52 
 
 
191 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  28.68 
 
 
167 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  27.41 
 
 
191 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  28.81 
 
 
183 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  38.03 
 
 
191 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.81 
 
 
183 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
191 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  26.52 
 
 
191 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  26.52 
 
 
191 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.93 
 
 
699 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  26.52 
 
 
191 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  26.52 
 
 
191 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  29.46 
 
 
180 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  30.19 
 
 
187 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.36 
 
 
206 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  26.52 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 
196 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
183 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
193 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
484 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
382 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45300  cytochrome C biogenesis protein CcmG  31.34 
 
 
180 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
203 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  28.8 
 
 
223 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3846  cytochrome c biogenesis protein CcmG  31.34 
 
 
180 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  27.91 
 
 
188 aa  50.1  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  37.5 
 
 
224 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0618  thiol-disulfide oxidoreductase, putative  23.39 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  27.27 
 
 
193 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  35.48 
 
 
223 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  28.89 
 
 
133 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  32.56 
 
 
186 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.96 
 
 
493 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.56 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_556  thiol-disulfide oxidoreductase  23.08 
 
 
179 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  32.26 
 
 
622 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  26.36 
 
 
193 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  26.36 
 
 
193 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.48 
 
 
168 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  29.88 
 
 
170 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
628 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.19 
 
 
650 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  35.09 
 
 
229 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  25.45 
 
 
193 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.74 
 
 
173 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 
228 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  26.92 
 
 
165 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  27.66 
 
 
390 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  39.58 
 
 
162 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  26.92 
 
 
172 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  30.23 
 
 
170 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  24.63 
 
 
187 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  42.55 
 
 
182 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  23.87 
 
 
184 aa  47  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  27.69 
 
 
193 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  25.21 
 
 
197 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  24.53 
 
 
161 aa  47  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2173  Redoxin domain protein  32.53 
 
 
336 aa  47  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.55 
 
 
199 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.23 
 
 
168 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  25.19 
 
 
182 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3062  thioredoxin-like protein  24.22 
 
 
180 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  25.21 
 
 
197 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1378  Redoxin domain protein  24 
 
 
220 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.677919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  26.61 
 
 
182 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  26.02 
 
 
691 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  30.33 
 
 
220 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.01 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30390  cytochrome C biogenesis protein  34.67 
 
 
176 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0772446  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  23.46 
 
 
189 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.95 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  24.38 
 
 
168 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
194 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  45.45 
 
 
188 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  29.63 
 
 
188 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
189 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  36.92 
 
 
178 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  31.33 
 
 
167 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  30.36 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.58 
 
 
639 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>