More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2453 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2453  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
557 aa  1153    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2065  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.32 
 
 
484 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.16 
 
 
164 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  36.19 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  24.26 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1863  Redoxin domain protein  30.15 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269933  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  30.48 
 
 
453 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
171 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  26.96 
 
 
232 aa  61.2  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.89 
 
 
650 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5968  Redoxin domain protein  31.37 
 
 
197 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566817  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.63 
 
 
437 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873558  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  31.31 
 
 
174 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0780  Redoxin domain protein  32.48 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  29.32 
 
 
168 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  30.36 
 
 
172 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.8 
 
 
331 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0596  Redoxin domain protein  36.27 
 
 
173 aa  58.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  30.47 
 
 
133 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.03 
 
 
169 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.93 
 
 
655 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  23.62 
 
 
155 aa  57.4  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0273  Redoxin domain protein  30 
 
 
379 aa  57.4  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.36 
 
 
424 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  27.43 
 
 
223 aa  57.4  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.18 
 
 
487 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  26.98 
 
 
466 aa  56.6  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.91 
 
 
445 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  27.88 
 
 
176 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  28.3 
 
 
161 aa  56.2  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  22.95 
 
 
173 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  28 
 
 
328 aa  55.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13488  hypothetical protein  27.88 
 
 
178 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
165 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  30.28 
 
 
238 aa  55.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  26 
 
 
172 aa  56.2  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  30.28 
 
 
238 aa  55.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.38 
 
 
194 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.36 
 
 
399 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.7 
 
 
187 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  26.89 
 
 
390 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.58 
 
 
455 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.58 
 
 
284 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48643  predicted protein  29.41 
 
 
415 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0241442  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  26.89 
 
 
224 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  28.69 
 
 
169 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 
409 aa  54.7  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  25.58 
 
 
188 aa  54.3  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  29.52 
 
 
187 aa  54.7  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  26.4 
 
 
209 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  23.81 
 
 
198 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  26.47 
 
 
182 aa  53.9  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.8 
 
 
360 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.19 
 
 
169 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  43.59 
 
 
195 aa  53.9  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.81 
 
 
192 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  26.21 
 
 
182 aa  53.5  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.95 
 
 
166 aa  53.5  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  27.12 
 
 
332 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  29.37 
 
 
285 aa  53.5  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.41 
 
 
179 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  32.48 
 
 
210 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  33.65 
 
 
238 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3943  redoxin domain-containing protein  28.97 
 
 
659 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  26.24 
 
 
164 aa  53.5  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.83 
 
 
173 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  27.12 
 
 
316 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  26.92 
 
 
191 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  27.12 
 
 
305 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  27.73 
 
 
193 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  28 
 
 
194 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  26.09 
 
 
174 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
194 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  25.93 
 
 
171 aa  52.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  26.72 
 
 
166 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
178 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  32.43 
 
 
197 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  27.42 
 
 
211 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  25.15 
 
 
182 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1084  thioredoxin family protein  27.41 
 
 
358 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.492261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  30.99 
 
 
269 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  24.8 
 
 
174 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
191 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  32.11 
 
 
158 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  24.32 
 
 
184 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.16 
 
 
661 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0371216  normal  0.0467727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  23.02 
 
 
172 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  26.27 
 
 
306 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  26.27 
 
 
316 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  28.33 
 
 
174 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  21.77 
 
 
155 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  29.59 
 
 
636 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  21.77 
 
 
155 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.79 
 
 
178 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0367  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
191 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  22.31 
 
 
160 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.8 
 
 
174 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  53.85 
 
 
109 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.46 
 
 
375 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64 
 
 
393 aa  51.2  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.370556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>