87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0487 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  43.24 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  33.94 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  28.4 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  27.64 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  24.03 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  22.88 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  28.39 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  31.19 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  26.32 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  30.28 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  28.44 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  25 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  30.28 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  30.28 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  30.28 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  27.73 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  29.36 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  26.79 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  26.79 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  24.55 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  24.55 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  27.43 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  24.55 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.63 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  26.76 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.24 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  24.32 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.97 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  23.97 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  36 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.97 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  23.97 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  22.88 
 
 		 279 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  24.47 
 
 		 269 aa  47.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  22.31 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  33 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  22.95 
 
 		 194 aa  47.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  22.31 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  22.31 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  23.53 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  24.36 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  30.13 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.3 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  27.94 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  28.26 
 
 		 278 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  30.13 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 		 271 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  30.13 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  23.87 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.97 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  35.11 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  35.48 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  29.75 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  27.64 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.75 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  27.34 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  35.11 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  29.75 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.75 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  29.75 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.09 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3292  Redoxin domain protein  32.67 
 
 		 453 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000783621  hitchhiker  0.000211392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.48 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  27.61 
 
 		 238 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  29.49 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  28.97 
 
 		 278 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  20.66 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.1 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  25 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  29.07 
 
 		 153 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  29.37 
 
 		 208 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  31.07 
 
 		 222 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  30.3 
 
 		 278 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.18 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.4 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  30 
 
 		 228 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  26.87 
 
 		 238 aa  41.2  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  24.22 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  23.26 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  27.27 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.75 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  23.47 
 
 		 270 aa  40.8  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>