123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3811 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 
208 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  87.02 
 
 
211 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  86.54 
 
 
211 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  86.54 
 
 
211 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  86.67 
 
 
210 aa  352  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  87.02 
 
 
211 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  85.58 
 
 
211 aa  347  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  83.89 
 
 
211 aa  342  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  60.94 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  54.64 
 
 
198 aa  216  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  56.32 
 
 
266 aa  208  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 
200 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 
208 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.29 
 
 
205 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.04 
 
 
213 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  46.53 
 
 
206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.73 
 
 
202 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  53.48 
 
 
196 aa  195  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  55.61 
 
 
197 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  46.24 
 
 
205 aa  171  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  38.82 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.26 
 
 
186 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.68 
 
 
173 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  29.5 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.67 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3859  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.1 
 
 
145 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.8 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
174 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.82 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.82 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  27.82 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.82 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  27.82 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.57 
 
 
715 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.98 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  28.36 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  28.81 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  29.37 
 
 
176 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0085  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.75 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  27.01 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  24.1 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.42 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.75 
 
 
168 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.69 
 
 
169 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.89 
 
 
191 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
188 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.87 
 
 
169 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.2 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  27.21 
 
 
170 aa  48.5  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.64 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  21.47 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.57 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  33.94 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  26.71 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  27.61 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  23.31 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  29.31 
 
 
172 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.89 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  30 
 
 
156 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
165 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  25.83 
 
 
165 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28.69 
 
 
167 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.53 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0194  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.69 
 
 
145 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.070617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1942  bacterioferritin comigratory protein-like  28.17 
 
 
150 aa  45.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.834483  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  31.03 
 
 
133 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.66 
 
 
284 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  28.36 
 
 
164 aa  45.1  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4771  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  28.19 
 
 
179 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.6 
 
 
175 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  25.2 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  31.15 
 
 
165 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.68 
 
 
194 aa  44.7  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.38 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  24.07 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  29.66 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  32.26 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5136  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.08 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3104  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.28 
 
 
475 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000481506  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.19 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1961  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.77 
 
 
371 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5727  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.76 
 
 
378 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  27.2 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  33.68 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  30.32 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  30.65 
 
 
437 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0863  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 
464 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>