More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12893 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  100 
 
 
173 aa  347  5e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11694  lipoprotein dsbF  55.22 
 
 
182 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.586251 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4951  redoxin domain-containing protein  44.44 
 
 
208 aa  120  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654401  decreased coverage  0.00344255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  41.18 
 
 
193 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1481  redoxin domain-containing protein  40.44 
 
 
191 aa  84.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240767  decreased coverage  0.0000344314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2076  redoxin domain-containing protein  38.68 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.06 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  35.09 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.67 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  40.43 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  32.71 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.85 
 
 
201 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  26.85 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.43 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.9 
 
 
178 aa  62.8  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  36.17 
 
 
203 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  32.97 
 
 
209 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  28.1 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  32.29 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  30.71 
 
 
192 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.57 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.97 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  24.62 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  31 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  33.61 
 
 
194 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.48 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
182 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  36.36 
 
 
176 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  29.93 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  29.03 
 
 
279 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.4 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  26.09 
 
 
173 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  25.47 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  32.03 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  35.9 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.23 
 
 
203 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  34.72 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  25.47 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.25 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  31.01 
 
 
269 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  28.79 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
278 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  25.47 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.84 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  34.78 
 
 
278 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  34.34 
 
 
200 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  27.56 
 
 
191 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.32 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.68 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  28.37 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.23 
 
 
376 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  33.7 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.47 
 
 
173 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  33.7 
 
 
278 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.42 
 
 
455 aa  54.3  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  26.5 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  28.1 
 
 
269 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  27.33 
 
 
735 aa  54.3  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 
179 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1313  Redoxin domain protein  28.21 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000515497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  26.06 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  35.11 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  32.47 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  27.74 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  38.57 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  27.48 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
269 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  34.41 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  23.6 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0338  thioredoxin-related  25.69 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.95 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  30.25 
 
 
267 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  31.18 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  32.97 
 
 
278 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  32.97 
 
 
278 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  24.77 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4485  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.52 
 
 
200 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000697653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
278 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  33.75 
 
 
447 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  29.31 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.34 
 
 
188 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  32.97 
 
 
184 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1793  thioredoxin family protein  29.91 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2853  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  28.49 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  31.13 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  28.57 
 
 
188 aa  51.6  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  27.91 
 
 
184 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  31.01 
 
 
455 aa  51.6  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3551  thioredoxin family protein  29.91 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  23.85 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  29.07 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0469  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  25.34 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  27.13 
 
 
269 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0817  Redoxin domain protein  28.21 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0724066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>