More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0759 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  100 
 
 
178 aa  361  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  66.46 
 
 
175 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  46.47 
 
 
170 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.43 
 
 
188 aa  168  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  44.58 
 
 
174 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 
182 aa  164  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  48.32 
 
 
152 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.03 
 
 
174 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.42 
 
 
174 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.21 
 
 
174 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.74 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  38.46 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  40.11 
 
 
187 aa  132  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  42.14 
 
 
184 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  40.25 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  36.75 
 
 
168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  36.14 
 
 
168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  40.25 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  36.14 
 
 
168 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  35.54 
 
 
168 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  35.54 
 
 
168 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  33.13 
 
 
164 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.59 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.48 
 
 
183 aa  111  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  32.53 
 
 
223 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  39.86 
 
 
165 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  47.32 
 
 
193 aa  101  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.67 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  29.41 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  34.55 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.52 
 
 
210 aa  88.2  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  29.49 
 
 
170 aa  88.2  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.8 
 
 
219 aa  84  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  28.38 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  29.05 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  26.55 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  26.49 
 
 
173 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.93 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.85 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  28.99 
 
 
396 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.57 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  29.25 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  29.66 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.85 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.48 
 
 
193 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  27.97 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.7 
 
 
403 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  29.25 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  25.41 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.48 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  27.78 
 
 
403 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.43 
 
 
171 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 
189 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  26.49 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  26.49 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  24.34 
 
 
167 aa  54.7  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  26.5 
 
 
173 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.49 
 
 
173 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.89 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  24.8 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  27.81 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  27.89 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  30.51 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.68 
 
 
433 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  24.79 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  25.41 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  24.27 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.46 
 
 
422 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3647  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.03 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.41 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  29.46 
 
 
167 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.25 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.85 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.32 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.67 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3409  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  30.23 
 
 
169 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.690578  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3890  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.83 
 
 
178 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0569168  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1546  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.83 
 
 
178 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4321  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25.34 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  28.23 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1036  thiol:disulfide interchange protein DsbE  23.81 
 
 
182 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9142  thioredoxin  25.26 
 
 
106 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  24 
 
 
211 aa  51.6  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.42 
 
 
247 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.73 
 
 
160 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  25.98 
 
 
205 aa  51.2  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  24.79 
 
 
168 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.02 
 
 
166 aa  51.2  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>