More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0565 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 183 aa  376  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  66.87 
 
 		 187 aa  244  6.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  62.03 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.37 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  36.84 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  35.76 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.75 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.75 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  33.33 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.6 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.22 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  35.93 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  32.62 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  31.02 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  32.26 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.06 
 
 		 166 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  34.21 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  32.67 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  32 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  35.15 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  35.96 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  33.09 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  32.67 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  32 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  32 
 
 		 168 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 		 193 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  33.14 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.11 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  34.06 
 
 		 165 aa  87.8  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  31.45 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  27.74 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.09 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  32 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  27.54 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.65 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  26.45 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  26.67 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  29.29 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  29.51 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.33 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  28.23 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  28.23 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  25.15 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  28.23 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3718  thioredoxin  26.45 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  hitchhiker  0.00138865 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  27.42 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  26.09 
 
 		 109 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  29.46 
 
 		 104 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.09 
 
 		 355 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  27.87 
 
 		 289 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  27.87 
 
 		 289 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  27.92 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  30.84 
 
 		 109 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  48.94 
 
 		 118 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  23.31 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  23.31 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  31.36 
 
 		 282 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  48.94 
 
 		 109 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  29.36 
 
 		 403 aa  52  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  27.18 
 
 		 223 aa  51.6  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  29.36 
 
 		 403 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  27.36 
 
 		 108 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 		 90 aa  52  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  23.31 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1978  thioredoxin  26.32 
 
 		 111 aa  51.6  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.274716  normal  0.21653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  26.42 
 
 		 116 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  24.3 
 
 		 108 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  28.97 
 
 		 109 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.48 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  30 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  28.85 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.14 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  30 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  25.71 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0858  thioredoxin  27.64 
 
 		 106 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.782394  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  30 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0769  thioredoxin family protein  31.48 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.409794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  22.79 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  30 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  25.71 
 
 		 272 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  26.36 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  25.22 
 
 		 109 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  23.02 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  28.85 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  28 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  27.78 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  26.45 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  26.95 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  25.21 
 
 		 108 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  25.76 
 
 		 326 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  22.79 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  23.81 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  26.13 
 
 		 107 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  23.81 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  29.66 
 
 		 282 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  32 
 
 		 259 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  29.66 
 
 		 282 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>