More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1075 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  100 
 
 
168 aa  333  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  99.4 
 
 
168 aa  332  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  98.21 
 
 
168 aa  329  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  97.62 
 
 
168 aa  301  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  97.02 
 
 
168 aa  298  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.81 
 
 
166 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  37.42 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  36.75 
 
 
178 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.36 
 
 
188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.42 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  36.48 
 
 
174 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.15 
 
 
174 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.36 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.76 
 
 
174 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  31.74 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  35.19 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  31.36 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  35.19 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.36 
 
 
219 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  41.59 
 
 
184 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  40.71 
 
 
184 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  40.91 
 
 
223 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  40.54 
 
 
184 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  33.54 
 
 
184 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  34.97 
 
 
170 aa  98.6  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  42.62 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.88 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  34.44 
 
 
152 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.25 
 
 
179 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  33.54 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  30.07 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  31.36 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.55 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.72 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  27.88 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  34.67 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.89 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  35.34 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1064  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  38.02 
 
 
361 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  31.9 
 
 
184 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.65 
 
 
178 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28.95 
 
 
167 aa  60.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  33.85 
 
 
422 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  27.52 
 
 
104 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  29.66 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  28.1 
 
 
191 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.73 
 
 
363 aa  58.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.35 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  29.31 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3536  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.76 
 
 
186 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0511  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
270 aa  57.8  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.662182 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  32.38 
 
 
102 aa  57.8  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  30.83 
 
 
143 aa  57.4  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.25 
 
 
433 aa  57.4  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  31.78 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  31.67 
 
 
205 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.53 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  31.96 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  28.91 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.29 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4580  thioredoxin  31.19 
 
 
107 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  hitchhiker  0.00134414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  32.29 
 
 
108 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  28.7 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.34 
 
 
355 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  29.73 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  33.88 
 
 
248 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  32.38 
 
 
209 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1546  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  23.87 
 
 
178 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.81 
 
 
160 aa  55.1  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.74 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  29.09 
 
 
403 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  24 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3890  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  23.87 
 
 
178 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0569168  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  29.91 
 
 
105 aa  54.7  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.92 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  33.68 
 
 
90 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  30.53 
 
 
91 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  31.06 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  30.93 
 
 
165 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  28.83 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  26.87 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 
191 aa  54.3  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  27.27 
 
 
191 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  24.82 
 
 
170 aa  53.9  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  24.55 
 
 
172 aa  54.3  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5402  thioredoxin  29.25 
 
 
107 aa  54.3  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2474  thiol:disulfide interChange protein DsbE  31.09 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.734452  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  32.58 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  28 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  34.62 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.96 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.18 
 
 
403 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4041  thiol:disulfide interChange protein DsbE  31.09 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4024  thiol:disulfide interChange protein DsbE  31.09 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>