More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3198 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
188 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  54.24 
 
 
182 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.14 
 
 
177 aa  217  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  53.01 
 
 
174 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.41 
 
 
174 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.41 
 
 
174 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.81 
 
 
174 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  39.43 
 
 
178 aa  168  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  40.74 
 
 
175 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  42.94 
 
 
170 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  39.74 
 
 
152 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  36.16 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  35.87 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.69 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  40.96 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  40.36 
 
 
168 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  39.51 
 
 
168 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  39.51 
 
 
168 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  39.51 
 
 
168 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  29.88 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  37.11 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  37.11 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  37.11 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.55 
 
 
166 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  34.59 
 
 
184 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  33.15 
 
 
223 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
179 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  32.69 
 
 
170 aa  98.2  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  34.78 
 
 
165 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  28.05 
 
 
170 aa  87.8  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  28.57 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  30.29 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.61 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.37 
 
 
219 aa  81.3  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  25.79 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.32 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  27.97 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
355 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  25.2 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  29.53 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.43 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  29.17 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.32 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  31.2 
 
 
269 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  29.2 
 
 
160 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.98 
 
 
422 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  27.78 
 
 
198 aa  55.1  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  26.85 
 
 
173 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  26.85 
 
 
173 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.62 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  29.25 
 
 
286 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.52 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.17 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  25.93 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  31.09 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.04 
 
 
446 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  24.68 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  28.69 
 
 
197 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
280 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  28.45 
 
 
211 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  30.25 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  26.21 
 
 
403 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  27.34 
 
 
173 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 
199 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  22.22 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  27.68 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  26.21 
 
 
403 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.17 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.5 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  26.72 
 
 
164 aa  51.2  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.5 
 
 
173 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  25.5 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25.5 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.97 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
447 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  26.83 
 
 
169 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1566  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.08 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  26.55 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  26.32 
 
 
363 aa  49.7  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  32.94 
 
 
278 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  29.52 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  27.36 
 
 
279 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  26.98 
 
 
199 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  29.9 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  27.18 
 
 
409 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  28.71 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.89 
 
 
206 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  25.15 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  33.04 
 
 
278 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  28.03 
 
 
311 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  28.1 
 
 
165 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1623  c-type cytochrome biogenesis protein/thioredoxin  28.08 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  32.14 
 
 
278 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  26.67 
 
 
184 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1492  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
193 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.45 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  24.8 
 
 
190 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>