280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0365 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  77.05 
 
 
183 aa  303  7e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.59 
 
 
183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  40.11 
 
 
178 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.16 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  35.76 
 
 
182 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  36.93 
 
 
175 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.62 
 
 
174 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  40.13 
 
 
174 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.79 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.79 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.29 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  39.82 
 
 
193 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  31.36 
 
 
168 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  30.77 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  35.1 
 
 
170 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  36.71 
 
 
184 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  35.76 
 
 
152 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  35.44 
 
 
184 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  34.81 
 
 
184 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  35.43 
 
 
168 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  34.81 
 
 
184 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  34.65 
 
 
168 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  34.65 
 
 
168 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.11 
 
 
166 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  35.11 
 
 
223 aa  99  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  36.15 
 
 
165 aa  97.8  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  32.16 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.37 
 
 
179 aa  87.8  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.77 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  28.4 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  31.61 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.41 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.48 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  29.38 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  28.48 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  28.1 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.67 
 
 
422 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  27.59 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
171 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  32.8 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  32.8 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  32.8 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  32.17 
 
 
437 aa  55.1  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.46 
 
 
433 aa  55.1  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  27.12 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  30.89 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  30.47 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  26.83 
 
 
170 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0769  thioredoxin family protein  32.11 
 
 
164 aa  52  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.409794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.79 
 
 
169 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  24.38 
 
 
173 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.32 
 
 
403 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  23.13 
 
 
279 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.02 
 
 
200 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  24.38 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.32 
 
 
403 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  23.75 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  23.75 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  26.42 
 
 
211 aa  50.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45300  cytochrome C biogenesis protein CcmG  33.61 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  27.12 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1789  Redoxin domain protein  28.12 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  23.75 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  23.75 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  39.71 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  23.75 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.36 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3846  cytochrome c biogenesis protein CcmG  32.77 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  26.56 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  34.94 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  23.12 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  25.74 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3409  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  40.62 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.690578  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.89 
 
 
447 aa  48.9  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0257  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.18 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0807  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  50 
 
 
227 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1467  Redoxin domain protein  26.15 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885317  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  24.44 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  21.88 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  27.27 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  25.96 
 
 
108 aa  48.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  25.74 
 
 
185 aa  48.1  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  23.12 
 
 
173 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  25.74 
 
 
185 aa  48.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3647  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  33.72 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  26.83 
 
 
112 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  26.83 
 
 
112 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  24.32 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  24.04 
 
 
286 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  24.32 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  24.32 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0061  Redoxin domain protein  24.43 
 
 
197 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  24.32 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>