More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1378 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  100 
 
 
175 aa  359  1e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  66.46 
 
 
178 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.74 
 
 
188 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  42.94 
 
 
170 aa  166  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  47.65 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  40.74 
 
 
182 aa  158  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  43.64 
 
 
174 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.42 
 
 
174 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.42 
 
 
174 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.88 
 
 
177 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.82 
 
 
174 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  36.81 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  37.42 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  36.81 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  36.2 
 
 
168 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  36.2 
 
 
168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.24 
 
 
166 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  35.96 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  36.93 
 
 
187 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  37.11 
 
 
184 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  35.22 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  34.59 
 
 
184 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  32.12 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.77 
 
 
183 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  32.08 
 
 
223 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.89 
 
 
179 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  33.13 
 
 
169 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  41.01 
 
 
165 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  35.29 
 
 
170 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.16 
 
 
219 aa  95.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  31.13 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  28.57 
 
 
188 aa  89  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  41.07 
 
 
193 aa  89  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  28.92 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.16 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  27.03 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  29.84 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  24.8 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.76 
 
 
187 aa  58.9  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  25.66 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.8 
 
 
171 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  24.58 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  27.27 
 
 
422 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  29.6 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1829  peroxiredoxin-like  22.44 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000091081  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  27.7 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  25.75 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.25 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  26.13 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2293  thioredoxin family protein  32 
 
 
183 aa  54.7  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  26.13 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.64 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.18 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.77 
 
 
288 aa  54.3  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2397  Redoxin domain protein  27.34 
 
 
267 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.675955  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  26.61 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.52 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2175  hypothetical protein  26.19 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  30.11 
 
 
437 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.83 
 
 
247 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  27.05 
 
 
363 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  31.2 
 
 
636 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  22.38 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.56 
 
 
409 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  29.25 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4551  redoxin domain-containing protein  24.82 
 
 
256 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.36 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.72 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.28 
 
 
181 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  28.95 
 
 
211 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3409  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  28.67 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.690578  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.87 
 
 
183 aa  52  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4321  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.06 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  23.84 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  27.63 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  23.73 
 
 
184 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  26.47 
 
 
118 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
355 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  25.69 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  20.65 
 
 
165 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  25.41 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  26.47 
 
 
109 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  27.87 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  23.58 
 
 
170 aa  50.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  27.37 
 
 
160 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  28.37 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>