More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0994 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0994  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  641    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  36.25 
 
 
316 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  35.92 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  36.18 
 
 
305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  35.28 
 
 
316 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  34.62 
 
 
306 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
306 aa  222  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  34.08 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.4 
 
 
355 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.2 
 
 
363 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1064  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  31.68 
 
 
361 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
189 aa  90.9  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
155 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  34.38 
 
 
155 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  35.11 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1823  redoxin domain-containing protein  36.92 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2154  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00992138  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  29.91 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.48 
 
 
178 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.26 
 
 
188 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  41.03 
 
 
181 aa  77  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2087  redoxin domain-containing protein  34.38 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0109878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  32.26 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  32.26 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.17 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  30.77 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  32.38 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  38.74 
 
 
155 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.82 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.74 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.67 
 
 
171 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  38.78 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  26.16 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4599  thioredoxin family protein  34.96 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  32.52 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  30.72 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  32.65 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  32.65 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  32.65 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  32.65 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  31.53 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.63 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.71 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  32.65 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  29.13 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  32.65 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
173 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.55 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  28.68 
 
 
205 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  28.85 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  33.66 
 
 
161 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  30.61 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  31.63 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  32.14 
 
 
159 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.94 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  34.38 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  34.69 
 
 
174 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.52 
 
 
191 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  34.71 
 
 
187 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.27 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0735  redoxin domain-containing protein  29.77 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  33.03 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  27.27 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  33.08 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  31.63 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.69 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  27.15 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  26.53 
 
 
204 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  27.64 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 
409 aa  65.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  33.04 
 
 
172 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  28.78 
 
 
269 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
183 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  35.04 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.43 
 
 
403 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
166 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.69 
 
 
199 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
164 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.43 
 
 
403 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.35 
 
 
206 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  32 
 
 
182 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  33.88 
 
 
172 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  29.2 
 
 
165 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  29.57 
 
 
165 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  29.57 
 
 
165 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  29.57 
 
 
156 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
182 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  32.22 
 
 
201 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  32.08 
 
 
164 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.96 
 
 
187 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  32.22 
 
 
194 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  30.1 
 
 
172 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.37 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>