72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3820 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 
202 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  54.5 
 
 
208 aa  224  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  49.21 
 
 
198 aa  188  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  48.72 
 
 
206 aa  188  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.73 
 
 
208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.79 
 
 
266 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  49.24 
 
 
211 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.77 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  49.75 
 
 
211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.73 
 
 
211 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.46 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  48.73 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  49.47 
 
 
195 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.78 
 
 
211 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.78 
 
 
211 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.04 
 
 
200 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.03 
 
 
205 aa  167  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  45.92 
 
 
196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  48.69 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  41.9 
 
 
205 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.56 
 
 
186 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  39.16 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.21 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.14 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  23.21 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  21.43 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  21.43 
 
 
191 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  24.24 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  20.24 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  20.24 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  20.24 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  20.24 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  20.83 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  20.24 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1839  cytochrome C biogenesis protein  27.12 
 
 
162 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0573703  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.42 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  30 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  20.22 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.4 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  27.54 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0273  Redoxin domain protein  30.28 
 
 
379 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.62 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1291  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.59 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  29.41 
 
 
176 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 
382 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  30.95 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  31.33 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  32.71 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.87 
 
 
207 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717599  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  24.82 
 
 
160 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3793  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.63 
 
 
393 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.2 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.92 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.12 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  24.2 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  29.03 
 
 
184 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.08 
 
 
342 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  29.73 
 
 
184 aa  42  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5727  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.64 
 
 
378 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6578  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
185 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.861573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  29.84 
 
 
184 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0085  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25.41 
 
 
170 aa  41.6  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  27.93 
 
 
184 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  29.84 
 
 
184 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  29.84 
 
 
184 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  29.84 
 
 
184 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.79 
 
 
178 aa  41.2  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>