82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4995 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  98.58 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  93.36 
 
 		 210 aa  377  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  91.47 
 
 		 211 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  91.47 
 
 		 211 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  87.02 
 
 		 208 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  61.66 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  55.15 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  54.74 
 
 		 266 aa  205  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  49.74 
 
 		 205 aa  204  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.67 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.04 
 
 		 213 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  49.24 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  50.53 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  43.5 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  51.87 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  47.22 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  40.46 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.46 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.68 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30.83 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  30.94 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  25.56 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.2 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  30.6 
 
 		 173 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  30.6 
 
 		 173 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  24.81 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  24.81 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  24.81 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  24.81 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  24.58 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  29.55 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.55 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  29.32 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  29.55 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  29.55 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  29.51 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4951  redoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654401  decreased coverage  0.00344255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.44 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  28.47 
 
 		 173 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.71 
 
 		 168 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.2 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  29.57 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.57 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  28.81 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.64 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  22.56 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28.93 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  27.59 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  20.31 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  29.63 
 
 		 164 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0085  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.89 
 
 		 170 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3859  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.58 
 
 		 145 aa  45.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.23 
 
 		 169 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  29.1 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  24.79 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  28.17 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.51 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  26.61 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2389  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0343728  normal  0.47432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.41 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.63 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.39 
 
 		 284 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2447  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  27.78 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.466136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  25.29 
 
 		 160 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.36 
 
 		 192 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2853  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  25.62 
 
 		 180 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  28.33 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  24.79 
 
 		 183 aa  41.2  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  34.34 
 
 		 190 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>