65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0563 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  79.79 
 
 
200 aa  323  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  53.66 
 
 
205 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.96 
 
 
211 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.96 
 
 
211 aa  203  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.96 
 
 
211 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  50.72 
 
 
210 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.56 
 
 
211 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50.26 
 
 
211 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  49.74 
 
 
211 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.29 
 
 
208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  44.56 
 
 
208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.09 
 
 
213 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  45.36 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  47.18 
 
 
195 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.15 
 
 
266 aa  168  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.03 
 
 
202 aa  167  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  39.79 
 
 
206 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  42.56 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  40.51 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.75 
 
 
186 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  34.3 
 
 
210 aa  107  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  26.79 
 
 
177 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  33.65 
 
 
184 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3383  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.1 
 
 
164 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3033  peroxiredoxin  30 
 
 
151 aa  51.2  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  31.25 
 
 
390 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  33.02 
 
 
270 aa  48.9  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  32.69 
 
 
184 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  31.43 
 
 
184 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 
173 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  29.63 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  34.81 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.73 
 
 
197 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.61 
 
 
184 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.95 
 
 
191 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.94 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3991  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.33 
 
 
329 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  29.52 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.98 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  27.4 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  27.65 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  26.71 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2112  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.78 
 
 
376 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.8 
 
 
381 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0250158  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  26.71 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  26.71 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  30.43 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  26.71 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4723  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.38 
 
 
155 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  26.71 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3881  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.68 
 
 
153 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  28.97 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  28.81 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  27.33 
 
 
191 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03730  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  24.8 
 
 
212 aa  42  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0104824  normal  0.12424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3658  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  30.5 
 
 
196 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.44 
 
 
219 aa  41.6  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1550  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.62 
 
 
176 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.277857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  31.3 
 
 
167 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  26.71 
 
 
191 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2307  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  32.94 
 
 
155 aa  41.6  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.78 
 
 
284 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>