79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0158 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0158  redoxin  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  51.61 
 
 		 196 aa  198  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  44.16 
 
 		 208 aa  195  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.72 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  48.11 
 
 		 195 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  45.55 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.53 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  48.7 
 
 		 197 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43.96 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  42.51 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43.68 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  44.85 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43.28 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43.28 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43.5 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  39.79 
 
 		 205 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  37.06 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  36.84 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.42 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  31.18 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  25.32 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  30.32 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  22.99 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  28.65 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.11 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  30.43 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.14 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.25 
 
 		 170 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.94 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25.14 
 
 		 173 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.14 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11694  lipoprotein dsbF  28.68 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.586251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  28.4 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  26.52 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  23.63 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  23.63 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  25.55 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  24.73 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  23.63 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0863  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.25 
 
 		 464 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  23.63 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  23.63 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.69 
 
 		 168 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  32.46 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  26.4 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  26.4 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.4 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.69 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.9 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.14 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.19 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2357  redoxin domain-containing protein  27.94 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1837  thioredoxin family protein  32.1 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654985  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  23.28 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  22.95 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  27.68 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  23.2 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  24.56 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  25.6 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1839  cytochrome C biogenesis protein  27.97 
 
 		 162 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0573703  normal  0.0160187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.86 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  23.17 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.03 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  22.53 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  22.4 
 
 		 278 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2548  redoxin domain-containing protein  27.52 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  20.83 
 
 		 278 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  24.24 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  22.14 
 
 		 193 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3409  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  23.08 
 
 		 169 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.690578  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0014  hypothetical protein  20.69 
 
 		 160 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.106983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>