89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4732 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  79.79 
 
 		 205 aa  323  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  55.72 
 
 		 205 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.03 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  51.03 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.03 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.03 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.97 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  45.18 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43.5 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.6 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  47.96 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.04 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.45 
 
 		 266 aa  175  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  42.13 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  37.06 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  40.4 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.33 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  36.63 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  26.61 
 
 		 177 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  30.54 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  29.37 
 
 		 390 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.41 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.34 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.98 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.68 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.81 
 
 		 173 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  28.47 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.4 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  30.48 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3991  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 		 329 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  25.18 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.68 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  23.97 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  26.51 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  23.97 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  23.97 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  23.97 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  23.97 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  24.65 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  25.57 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  25.89 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3033  peroxiredoxin  22.6 
 
 		 151 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2307  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  32.58 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  27.74 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1488  hypothetical protein  28.91 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  30.53 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.42 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 381 aa  45.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0250158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  28.57 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.29 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4277  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.03 
 
 		 488 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 		 382 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  22.92 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4120  redoxin domain-containing protein  36.47 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.585528  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  29.81 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3881  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.67 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.09 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.9 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3383  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.95 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1206  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.23 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.31 
 
 		 715 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2986  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  30.34 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2548  redoxin domain-containing protein  26.26 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1208  periplasmic protein thiol  27.84 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.4 
 
 		 360 aa  42.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.62 
 
 		 169 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0274  redoxin  25.96 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3149  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 		 504 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.05 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000412692  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  28.16 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3093  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.89 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06068  C-type cytochrome biogenesis protein/thioredoxin  24.17 
 
 		 186 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000294446  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00859  C-type cytochrome biogenesis protein/thioredoxin  24.17 
 
 		 186 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00856389  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1443  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  32.14 
 
 		 155 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.269281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0085  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  26.14 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2785  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25.93 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.4 
 
 		 173 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3716  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.65 
 
 		 153 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0540539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1872  heat shock protein DnaJ-like  21.31 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.506662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01441  putative bacterioferritin comigratory (BCP) protein  32.14 
 
 		 155 aa  41.2  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.758447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.18 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>