88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5060 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  98.1 
 
 
211 aa  420  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  96.21 
 
 
210 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  91 
 
 
211 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  91.47 
 
 
211 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  88.63 
 
 
211 aa  361  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  86.54 
 
 
208 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  62.69 
 
 
195 aa  228  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  55.33 
 
 
198 aa  219  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.96 
 
 
205 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.03 
 
 
200 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  55.26 
 
 
266 aa  204  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.63 
 
 
208 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.33 
 
 
213 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.78 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  51.58 
 
 
196 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  43.28 
 
 
206 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  53.48 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  47.98 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  41.92 
 
 
210 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.01 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.68 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.38 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  29.1 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.1 
 
 
173 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  30.22 
 
 
174 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
171 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  24.81 
 
 
191 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 
206 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  23.16 
 
 
177 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.03 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  27.82 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.03 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28.03 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  28.03 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  24.81 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  25.98 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  24.81 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  20.83 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  24.06 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  31.85 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  27.08 
 
 
173 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.46 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  30.16 
 
 
174 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  29.82 
 
 
193 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  28.81 
 
 
173 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.59 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  23.31 
 
 
191 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  27.64 
 
 
167 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.33 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2462  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 
267 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  29.17 
 
 
182 aa  45.1  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  27.66 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  28.24 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0085  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25.62 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  24.14 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  27.05 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  31.03 
 
 
133 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  25.83 
 
 
165 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3104  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.48 
 
 
475 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000481506  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3859  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.87 
 
 
145 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  28.57 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.45 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  26.98 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  25.86 
 
 
160 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0863  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.29 
 
 
464 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
160 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  25.2 
 
 
173 aa  42  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  24.59 
 
 
201 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.09 
 
 
188 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  27.35 
 
 
176 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0273  Redoxin domain protein  25.36 
 
 
379 aa  42  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
165 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
165 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.2 
 
 
170 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  25.74 
 
 
176 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  27.59 
 
 
172 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.53 
 
 
168 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 
156 aa  41.6  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.35 
 
 
174 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>