84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3104 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3104  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
475 aa  990    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000481506  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4277  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.19 
 
 
488 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0863  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.27 
 
 
464 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0134  thiol-disulfide isomerase  36.84 
 
 
474 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00111234  normal  0.144049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3043  thioredoxin family protein  24.59 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5957  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.15 
 
 
378 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131947  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.34 
 
 
715 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3793  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.76 
 
 
393 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.85 
 
 
288 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2112  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.55 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278161  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  25.54 
 
 
198 aa  57.4  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3991  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.15 
 
 
329 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2523  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.434668  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.93 
 
 
173 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  25.37 
 
 
390 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25.93 
 
 
173 aa  53.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4669  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.4 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.79 
 
 
381 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3992  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.29 
 
 
376 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.984971  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  23.02 
 
 
173 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
180 aa  51.6  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  25 
 
 
455 aa  51.2  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4777  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.93 
 
 
378 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1793  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.4 
 
 
390 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.33 
 
 
380 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.48 
 
 
399 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  24.49 
 
 
173 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.19 
 
 
173 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  24.66 
 
 
173 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2276  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.43 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.54286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.16 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  23.97 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7187  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.05 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  23.97 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  23.97 
 
 
173 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  23.97 
 
 
173 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
195 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 
195 aa  48.5  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
173 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  23.74 
 
 
173 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  27.13 
 
 
192 aa  47.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.06 
 
 
381 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0250158  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.67 
 
 
376 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.64 
 
 
380 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0802  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.58 
 
 
164 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  31.3 
 
 
133 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1961  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.86 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  24.17 
 
 
167 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  26.24 
 
 
164 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0908  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.2 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000924853 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0273  Redoxin domain protein  24.53 
 
 
379 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0698  putative lipoprotein  18.82 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000524405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  23.27 
 
 
174 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  29.37 
 
 
183 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
181 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  23.85 
 
 
182 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  23.46 
 
 
369 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1833  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.78 
 
 
360 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  21.8 
 
 
184 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  25 
 
 
170 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  22.61 
 
 
165 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  20.42 
 
 
169 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_002936  DET0618  thiol-disulfide oxidoreductase, putative  26.83 
 
 
178 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  23.48 
 
 
165 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  23.91 
 
 
173 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.63 
 
 
372 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2106  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.84 
 
 
367 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  25.64 
 
 
161 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  24.14 
 
 
188 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  29.19 
 
 
191 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3769  redoxin domain-containing protein  21.88 
 
 
167 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3227  redoxin family protein  22.22 
 
 
297 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  26.79 
 
 
191 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2011  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.84 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  26.79 
 
 
191 aa  43.9  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  26.79 
 
 
191 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  26.79 
 
 
191 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  26.4 
 
 
201 aa  43.5  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  22.01 
 
 
328 aa  43.5  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4031  Redoxin domain protein  25.19 
 
 
376 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  26.61 
 
 
174 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  26.79 
 
 
191 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02625  hypothetical protein  20.69 
 
 
466 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.79 
 
 
191 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>