48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4078 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  58.85 
 
 		 198 aa  224  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  63.21 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  63.54 
 
 		 211 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  62.69 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  62.69 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  62.69 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  61.66 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  61.98 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  60.94 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  48.11 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.44 
 
 		 213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.96 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.18 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  49.47 
 
 		 202 aa  177  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  47.62 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  45.6 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  44.56 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  47.09 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.33 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  41.07 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4277  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 		 488 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  21.43 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  26.5 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  26.5 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  26.5 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  26.5 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.65 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  28.04 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.11 
 
 		 671 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  25.64 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  25.64 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.64 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 671 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  20.23 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 671 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0863  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.83 
 
 		 464 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  24.79 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.54 
 
 		 175 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  26.19 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717599  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.8 
 
 		 171 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1961  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24 
 
 		 371 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  26.67 
 
 		 187 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.23 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>