27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1687 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  71.43 
 
 		 197 aa  275  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  68.42 
 
 		 266 aa  262  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  51.61 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50.51 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  53.48 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  52.94 
 
 		 211 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  48.15 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.58 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  51.58 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.58 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.58 
 
 		 211 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50.53 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50.53 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  47.62 
 
 		 195 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  47.59 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  45.92 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  42.13 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  42.56 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  40.1 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.01 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  37.31 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  19.5 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.45 
 
 		 355 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12893  soluble secreted antigen mpt53 precursor  27.27 
 
 		 173 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2354  hypothetical protein  32.73 
 
 		 254 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000019812  unclonable  0.000000147886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1255  hypothetical protein  30.91 
 
 		 254 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>