93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3252 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  54.5 
 
 		 202 aa  224  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.53 
 
 		 266 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  44.16 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  50 
 
 		 208 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.63 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.63 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  46.63 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  50.51 
 
 		 196 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  49.74 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  48.19 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.67 
 
 		 211 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  44.56 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.15 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  43.5 
 
 		 200 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  49.74 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  45.6 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  44.56 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  39.32 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  40.59 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  44.91 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.06 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.73 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  23.78 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  34.34 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  26.19 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  27.83 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0284  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.07 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  31.68 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.68 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  32.14 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  28.12 
 
 		 158 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.53 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  32.14 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.58 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2173  Redoxin domain protein  26.81 
 
 		 336 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  28.81 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  25 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1412  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  25 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.49361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.37 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.540722  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0591  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.8 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0918415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1940  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  24.63 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.78 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.36 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2029  hypothetical protein  29.85 
 
 		 363 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23797  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  32.52 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.42 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  27.34 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  25.36 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  19.53 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2785  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  29.41 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0948  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.28 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  26.32 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0577  redoxin  24.24 
 
 		 172 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.41 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  25.42 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 		 173 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0371  thioredoxin  25.6 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  20.31 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  25.2 
 
 		 173 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 266 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.56 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2855  Redoxin domain protein  31.67 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  28.3 
 
 		 270 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  16.84 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  20.93 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  21.71 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2978  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.52 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  25.13 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  20.93 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  20.16 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  25.49 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  20.16 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  20.16 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  26.5 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  20.16 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.58 
 
 		 171 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.33 
 
 		 169 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  25.49 
 
 		 194 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  20.16 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  27.5 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  26.67 
 
 		 170 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  27.4 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  23.53 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  18.6 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.17 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2986  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  23.97 
 
 		 155 aa  41.6  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.76 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>