43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4364 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4364  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  100 
 
 		 266 aa  527  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1687  hypothetical protein  68.42 
 
 		 196 aa  262  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  67.89 
 
 		 197 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0158  redoxin  50 
 
 		 206 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.913611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3252  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.53 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00129435  hitchhiker  0.00268285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3811  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  56.32 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.464126  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3582  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  56.06 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4995  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  54.74 
 
 		 211 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5224  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  55.26 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5060  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  55.26 
 
 		 211 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3307  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  55.26 
 
 		 211 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0603  hypothetical protein  54.74 
 
 		 210 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4470  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  54.74 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3820  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  51.79 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2654  hypothetical protein  52.11 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4732  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.45 
 
 		 200 aa  175  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0677851  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2222  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.12 
 
 		 213 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4078  hypothetical protein  50 
 
 		 195 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0563  methylamine dehydrogenase accessory protein MauD  47.15 
 
 		 205 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0550  hypothetical protein  42.78 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.664672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2336  putative methylamine utilization protein MauD  41.1 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2340  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.33 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  26.25 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2946  hypothetical protein  20.21 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000526049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  28.83 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0321  hypothetical protein  20.5 
 
 		 177 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  25.29 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  31.54 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.739092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0805  peroxiredoxin-like  25.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  28.95 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  27.35 
 
 		 180 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1942  bacterioferritin comigratory protein-like  27.08 
 
 		 150 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.834483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.62 
 
 		 171 aa  43.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.87 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717599  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2389  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.52 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0343728  normal  0.47432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.27 
 
 		 189 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.61 
 
 		 355 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  30.77 
 
 		 182 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2788  putative thiol:disulfide interchange protein  27.27 
 
 		 195 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.982955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 		 160 aa  42.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  22.22 
 
 		 173 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.96 
 
 		 272 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>