More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2357 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2357  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  352  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  34.65 
 
 
447 aa  68.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  27.74 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  36.72 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  27.22 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.78 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  32.33 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.96 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3457  hypothetical protein  32.05 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  29.01 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  28.86 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  31.29 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.1 
 
 
288 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  26.95 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  27.27 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2855  Redoxin domain-containing protein  30 
 
 
160 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
203 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
183 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.82 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  27.85 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  27.69 
 
 
167 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  27.85 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  27.85 
 
 
182 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  31.45 
 
 
224 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  25.81 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  26.03 
 
 
179 aa  57.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  31.01 
 
 
169 aa  57.8  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  27.97 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  28.48 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  25.81 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.75 
 
 
175 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  28.79 
 
 
209 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3418  thioredoxin-like protein  27.56 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308929  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  27.33 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  28.95 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.71 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  28.95 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.1 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  27.34 
 
 
165 aa  54.3  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.08 
 
 
455 aa  54.3  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  27.66 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0273  Redoxin domain protein  45.65 
 
 
379 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.443578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.31 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  24.5 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  24 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  29.69 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1383  thioredoxin family protein  28 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12426  normal  0.0879111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  27.27 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  27.34 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.82 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  27.74 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3227  redoxin family protein  26.52 
 
 
297 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  29.66 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  25.36 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  23.91 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  32.33 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  28.06 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  31.5 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4277  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26 
 
 
488 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0388  redoxin domain-containing protein  30.07 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017122 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  29.79 
 
 
469 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1226  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.89 
 
 
679 aa  52.4  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18591  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  27.82 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  28.07 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  28.83 
 
 
165 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
171 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
378 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  25 
 
 
194 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2801  thiol-disulfide interchange protein  29.73 
 
 
153 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00941693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1165  thioredoxin family protein, putative  28.35 
 
 
202 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.39 
 
 
174 aa  52  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  30.23 
 
 
222 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
178 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  24.19 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0107  Redoxin domain protein  32.86 
 
 
455 aa  52  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  27.59 
 
 
133 aa  51.6  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.68 
 
 
194 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5749  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.37 
 
 
380 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566272  normal  0.459715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0802  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.87 
 
 
589 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.3 
 
 
609 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  25.69 
 
 
172 aa  51.2  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  28.79 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  25.42 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.71 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0866  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.62 
 
 
183 aa  51.2  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>