64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2995 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2995  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  333  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.399401  normal  0.194797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0487  hypothetical protein  43.24 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.933254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0327  signal peptide protein  30.52 
 
 		 166 aa  90.5  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4092  signal peptide protein  35.71 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1050  signal peptide protein  28.57 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1600  hypothetical protein  28.75 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1023  putative signal peptide protein  26.58 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2933  hypothetical protein  28.46 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123525  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2997  hypothetical protein  27.69 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.566272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2904  signal peptide protein  25 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0908  signal peptide protein  29.68 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0998  hypothetical protein  25.58 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0148  hypothetical protein  25.58 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2628  hypothetical protein  25.58 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.282554  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0475  hypothetical protein  25.58 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4532  putative thiol-disulfide isomerase/thioredoxins-like protein  28.93 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2386  hypothetical protein  22.15 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0884  hypothetical protein  22.64 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0678  redoxin domain-containing protein  23.23 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.118036  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0872  hypothetical protein  21.52 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4120  hypothetical protein  20.89 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000520793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4138  putative signal peptide protein  23.66 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.809952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4250  signal peptide protein  23.66 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.148773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  29.29 
 
 		 332 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_003296  RS05314  signal peptide protein  20.53 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.450709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4145  redoxin domain-containing protein  23.23 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  30.36 
 
 		 279 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.21 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  28.21 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  28.21 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28.21 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.21 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1906  hypothetical protein  34.94 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.203094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.21 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1906  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.56 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  27.55 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  32.84 
 
 		 269 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5120  redoxin domain-containing protein  33.93 
 
 		 269 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  27.35 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.35 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.35 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0212  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.64 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3937  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  28.44 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.62 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  32.14 
 
 		 269 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4837  redoxin  28.04 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4186  redoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.855693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4210  redoxin domain-containing protein  27.1 
 
 		 269 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  25.21 
 
 		 278 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  26.47 
 
 		 278 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3329  redoxin domain-containing protein  28.04 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2761  thiol:disulfide interchange protein  27.07 
 
 		 278 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3802  redoxin domain-containing protein  31.37 
 
 		 278 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 278 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  29.33 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32600  thiol:disulfide interchange protein  27.07 
 
 		 278 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.251961  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30 
 
 		 194 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0233  Redoxin domain protein  21.25 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.972798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  31.37 
 
 		 222 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.51 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2650  hypothetical protein  29.35 
 
 		 304 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.141577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>