More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_36100  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  100 
 
 
199 aa  390  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.733085  normal  0.581528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0256  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.43 
 
 
226 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2864  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.85 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4815  redoxin  37.96 
 
 
215 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.502613  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5202  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.96 
 
 
215 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000747567 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4901  redoxin domain-containing protein  37.96 
 
 
215 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5432  redoxin domain-containing protein  41.78 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97982  normal  0.410286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0508  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.14 
 
 
206 aa  98.2  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13704  membrane-anchored thioredoxin-like protein  41.62 
 
 
227 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0163498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.97 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1374  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.5 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.251061  normal  0.0564426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3929  Redoxin domain protein  43.17 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  34.93 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.83 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0341  redoxin domain-containing protein  34.46 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.5 
 
 
433 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0940  periplasmic protein thiol/disulfide oxidoreductase DsbE  38.96 
 
 
185 aa  61.2  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.98 
 
 
355 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.2 
 
 
179 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1852  putative thioredoxin  41.57 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175078  normal  0.495272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4758  redoxin domain-containing protein  34.44 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0366616  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1992  twin-arginine translocation pathway signal  36.28 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4318  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.04 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.077918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.06 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  37.66 
 
 
238 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  37.66 
 
 
238 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0520  Redoxin domain protein  37.06 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3246  redoxin domain-containing protein  56.76 
 
 
266 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575298  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1805  thiol-disulfide interchange protein  34.21 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0451  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  34.21 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  32.56 
 
 
248 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.67 
 
 
184 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0908  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.98 
 
 
405 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000924853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0664  redoxin domain-containing protein  35.34 
 
 
238 aa  54.7  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  43.66 
 
 
238 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.17 
 
 
167 aa  54.7  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.14 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  31.54 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  38.94 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.61 
 
 
280 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  28.24 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  29.03 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
305 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 
332 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  35.34 
 
 
285 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  39.36 
 
 
276 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1638  thioredoxin family protein  33.75 
 
 
328 aa  52  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0098  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  27.27 
 
 
203 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2705  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  35.71 
 
 
205 aa  52  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.295459  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.63 
 
 
198 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  34.34 
 
 
106 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.73 
 
 
179 aa  51.6  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  29.13 
 
 
278 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2883  Redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
270 aa  51.6  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  30.83 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  38.46 
 
 
179 aa  51.2  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  28.43 
 
 
316 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  26.98 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  40.98 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  23.02 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  33.02 
 
 
133 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2634  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.06 
 
 
272 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3738  redoxin domain-containing protein  39.13 
 
 
268 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  27.12 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1408  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  32.99 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
279 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  30.59 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  35.35 
 
 
106 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  48.28 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.48 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0096  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  32.43 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.68 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  35.71 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.86 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.59 
 
 
363 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  28.57 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  27.45 
 
 
316 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1759  hypothetical protein  46.3 
 
 
279 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.33 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4982  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  43.08 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  26.79 
 
 
159 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  30.4 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.25 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  34.34 
 
 
106 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  51.79 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>