More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4177 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4177  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
403 aa  791    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5034  Redoxin domain protein  75.19 
 
 
394 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6990  hypothetical protein  73.58 
 
 
371 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62876  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0201  Redoxin domain protein  41.67 
 
 
368 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0260  Redoxin domain protein  29.92 
 
 
730 aa  70.1  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00568025  normal  0.921803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.82 
 
 
183 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.86 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1864  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.89 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0158194  normal  0.397812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  37.14 
 
 
209 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.9 
 
 
174 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
174 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  31.54 
 
 
171 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.57 
 
 
650 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  36.64 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  33.93 
 
 
209 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  31.48 
 
 
182 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
175 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  29.52 
 
 
200 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36790  thioredoxin  32.74 
 
 
156 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  33.96 
 
 
192 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2714  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  29.9 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.420342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
182 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  32.81 
 
 
185 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  33.94 
 
 
166 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  26.21 
 
 
636 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 
331 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  27.45 
 
 
170 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.61 
 
 
187 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  28.06 
 
 
447 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  28.7 
 
 
176 aa  53.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  34.45 
 
 
169 aa  53.5  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  33.63 
 
 
183 aa  53.5  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  29.91 
 
 
170 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  30.56 
 
 
180 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  27.74 
 
 
178 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.75 
 
 
189 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.25 
 
 
169 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
178 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  29.81 
 
 
168 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1003  periplasmic protein thiol  34.26 
 
 
178 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0767014  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  26.67 
 
 
181 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  33.9 
 
 
184 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  28.47 
 
 
173 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  33.03 
 
 
179 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  28.47 
 
 
173 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.93 
 
 
288 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  31.19 
 
 
173 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.25 
 
 
169 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  29.55 
 
 
192 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  33.91 
 
 
188 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
170 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  29.92 
 
 
168 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1378  Redoxin domain protein  29.71 
 
 
220 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.677919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  35.25 
 
 
193 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.94 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  31.62 
 
 
205 aa  51.6  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  48.21 
 
 
178 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4040  electron transport protein SCO1/SenC like  27.21 
 
 
201 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  28.47 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  31.09 
 
 
174 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  39.71 
 
 
162 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.08 
 
 
191 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  31.25 
 
 
170 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  28.47 
 
 
173 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.48 
 
 
185 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  26.77 
 
 
176 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  48.21 
 
 
182 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  28.87 
 
 
199 aa  51.2  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4183  Redoxin domain protein  27.21 
 
 
201 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  27.74 
 
 
173 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1688  thioredoxin, putative  30.19 
 
 
155 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.545472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.6 
 
 
179 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.7 
 
 
232 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  26.09 
 
 
179 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  34.26 
 
 
180 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  37.62 
 
 
172 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3701  thioredoxin, putative  30.19 
 
 
155 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.304862  decreased coverage  0.000242326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4156  Redoxin domain protein  27.21 
 
 
204 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.042351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.19 
 
 
192 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  27.06 
 
 
143 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  30.08 
 
 
183 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.23 
 
 
173 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  32.48 
 
 
183 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.77 
 
 
186 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  30.08 
 
 
182 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  32.5 
 
 
175 aa  49.7  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0664  redoxin domain-containing protein  33.87 
 
 
238 aa  49.7  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  32.08 
 
 
196 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  23.39 
 
 
165 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  33.06 
 
 
183 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  26 
 
 
185 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  30.19 
 
 
173 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  30.19 
 
 
173 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  25.78 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.66 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  25.78 
 
 
194 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.5 
 
 
184 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  25.2 
 
 
176 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  26.81 
 
 
178 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  29.32 
 
 
182 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>