36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6990 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_6990  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  725    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4177  redoxin domain-containing protein  75.8 
 
 		 403 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5034  Redoxin domain protein  72.22 
 
 		 394 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0201  Redoxin domain protein  43.85 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1864  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0158194  normal  0.397812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  32.58 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0260  Redoxin domain protein  26.98 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00568025  normal  0.921803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.67 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  32.17 
 
 		 209 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.76 
 
 		 650 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2557  putative heme-binding protein  25.88 
 
 		 143 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  28.79 
 
 		 192 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  27.52 
 
 		 182 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  30.36 
 
 		 209 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  27.48 
 
 		 171 aa  46.6  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  28.45 
 
 		 165 aa  46.6  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1003  periplasmic protein thiol  32.08 
 
 		 178 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0767014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  29.13 
 
 		 166 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  27 
 
 		 200 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  33.96 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.31 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  31.09 
 
 		 169 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  33.33 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0251  redoxin domain-containing protein  33.08 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.44 
 
 		 192 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  24.09 
 
 		 178 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  34.35 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  29.13 
 
 		 196 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  27.54 
 
 		 199 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.38 
 
 		 171 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  29.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  29.91 
 
 		 173 aa  43.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 		 174 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.43 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  27.2 
 
 		 185 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4951  redoxin domain-containing protein  31.86 
 
 		 208 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654401  decreased coverage  0.00344255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>