139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5034 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5034  Redoxin domain protein  100 
 
 		 394 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4177  redoxin domain-containing protein  72.41 
 
 		 403 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6990  hypothetical protein  71.72 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0201  Redoxin domain protein  37.88 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1864  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.71 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0158194  normal  0.397812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0260  Redoxin domain protein  26.12 
 
 		 730 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00568025  normal  0.921803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  36.52 
 
 		 209 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  34.29 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0444  redoxin superfamily protein  24.81 
 
 		 160 aa  55.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1597  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.82 
 
 		 650 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.596223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  33.02 
 
 		 172 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  31.82 
 
 		 192 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  27.56 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.55 
 
 		 247 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  32.52 
 
 		 160 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  31.86 
 
 		 182 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3001  redoxin domain-containing protein  31.07 
 
 		 196 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.62 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  31.78 
 
 		 173 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  32.2 
 
 		 205 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2205  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.36 
 
 		 232 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.37 
 
 		 487 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  29.29 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  31.13 
 
 		 133 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  32.14 
 
 		 184 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32.54 
 
 		 188 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.81 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  25.64 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  29.92 
 
 		 170 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  26.79 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  27.27 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  27.41 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  31.43 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  25.69 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  28.7 
 
 		 180 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  30.16 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.02 
 
 		 183 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2789  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0340892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.47 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1889  thioredoxin family protein  28.45 
 
 		 174 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0172229 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1947  redoxin  29.2 
 
 		 198 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  29.52 
 
 		 155 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4009  Redoxin domain protein  33.8 
 
 		 636 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  26.77 
 
 		 185 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  29.52 
 
 		 155 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  29.52 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  29.52 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  23.08 
 
 		 179 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.2 
 
 		 167 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  29.25 
 
 		 183 aa  47.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  27.48 
 
 		 174 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.44 
 
 		 178 aa  47.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  25.98 
 
 		 186 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  27.1 
 
 		 167 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.44 
 
 		 175 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  30 
 
 		 171 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  27.78 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.48 
 
 		 185 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.08 
 
 		 655 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  29.37 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  28.97 
 
 		 168 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0596  Redoxin domain protein  28.7 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.53 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.47 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3943  redoxin domain-containing protein  24.18 
 
 		 659 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  26 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  26.72 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3424  Redoxin domain protein  31.15 
 
 		 183 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0519333  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.74 
 
 		 171 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  21.7 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2790  putative electron transfer protein  24.3 
 
 		 184 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  26 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  29.53 
 
 		 167 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  30.28 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  23.85 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.11 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1076  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.53 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  hitchhiker  0.00953303 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  26 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.73 
 
 		 181 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4240  redoxin domain-containing protein  28.7 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0223129  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  23.85 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  27.21 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  30.25 
 
 		 166 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04554  thioredoxin  27.36 
 
 		 200 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  27.52 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5968  Redoxin domain protein  28.57 
 
 		 197 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.566817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  28.3 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  31.25 
 
 		 173 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  24.22 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0534  putative thioredoxin  29.84 
 
 		 180 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.677226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  23.85 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  28.81 
 
 		 169 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  23.85 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  23.85 
 
 		 178 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  26.85 
 
 		 182 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4515  Redoxin domain protein  31.5 
 
 		 182 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  27.88 
 
 		 211 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>