More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1212 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  47.03 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  47.03 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  47.03 
 
 
185 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  34.93 
 
 
211 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  35.33 
 
 
184 aa  136  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  37.44 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  40.76 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1328  thiredoxin  30.43 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.56 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.3 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.61 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.65 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  33.7 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  23.5 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  30.43 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.98 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  23.17 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  28.87 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  29.91 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2283  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  25 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.5 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  29.37 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.46 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  29.37 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.46 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0844  putative lipoprotein thiredoxin  28.02 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1376  Redoxin domain protein  27.97 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0681198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1441  Redoxin domain protein  28.45 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  26.57 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.57 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.88 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0330837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  30.73 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2118  thioredoxin  26.42 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.03 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.76 
 
 
173 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.07 
 
 
171 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  26.92 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1163  conserved hypothetical protein, possible lipoprotein thioredoxin  25.84 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0478  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
306 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3552  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
306 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.57 
 
 
173 aa  61.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  26.21 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  31.34 
 
 
180 aa  61.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  20.44 
 
 
201 aa  60.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3887  redoxin domain-containing protein  28.3 
 
 
316 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4669  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
381 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4031  Redoxin domain protein  24.37 
 
 
376 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0957968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.56 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.03 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0446  redoxin domain-containing protein  27.67 
 
 
316 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.98 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0476  redoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
306 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.35 
 
 
188 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1852  thioredoxin family protein  29.29 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.056942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4009  redoxin domain-containing protein  34.48 
 
 
332 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1627  thioredoxin family protein  29.29 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1597  thioredoxin family protein  29.29 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0109831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1829  thioredoxin family protein  29.29 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3943  Redoxin domain protein  31.37 
 
 
447 aa  58.9  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.42 
 
 
166 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3813  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
305 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1647  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.99 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  27.61 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  28 
 
 
166 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1648  thioredoxin family protein  29.29 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.29 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1779  thioredoxin family protein  29.29 
 
 
184 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.710861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  32.14 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  27.56 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  27.61 
 
 
167 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  26 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7128  hypothetical protein  35.65 
 
 
369 aa  58.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.97 
 
 
187 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.2 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  25.27 
 
 
182 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1904  thioredoxin family protein  27.66 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000368388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  25.6 
 
 
403 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1112  thioredoxin domain-containing protein  27.64 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3793  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.12 
 
 
393 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  24.22 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
455 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  23.77 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  18.9 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  27.19 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0027  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30 
 
 
409 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25 
 
 
403 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.43 
 
 
180 aa  56.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1491  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.83 
 
 
247 aa  55.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.327411 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  24.8 
 
 
167 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  27.18 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  25.74 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  28.45 
 
 
167 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  28.26 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  24.41 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>