57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1163 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1163  conserved hypothetical protein, possible lipoprotein thioredoxin  100 
 
 		 165 aa  328  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1837  thioredoxin family protein  49.68 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2026  thioredoxin family protein  48.39 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00455292  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0444  redoxin superfamily protein  37.34 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0769  thioredoxin family protein  35.4 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.409794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0530  hypothetical protein  34.69 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.473592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0427  thioredoxin family protein  34.78 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0156232  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0521  putative lipoprotein  31.07 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.747119  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1341  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1222  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1656  thioredoxin family protein  46.51 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0500  thiredoxin  27.21 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1212  conserved hypothetical lipoprotein  25.84 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0882  Redoxin domain protein  28.49 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0199  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1328  thiredoxin  31.43 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1396  thiredoxin  33.07 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1311  transporter  28.8 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0971109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  30.58 
 
 		 184 aa  51.2  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  26.96 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  31.37 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.84 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  29.57 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  25 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2785  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  32.8 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.69 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  23.15 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.15 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  29.37 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  29.84 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.21 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0797  hypothetical protein  30.28 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.22 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.03 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  29.03 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.79 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.13 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  29.03 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  28.07 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  28.07 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  29.03 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0559  redoxin domain-containing protein  28.45 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  29.03 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  29.03 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3484  redoxin domain-containing protein  27.64 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.234166  normal  0.21665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3550  redoxin domain-containing protein  26.17 
 
 		 278 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.054429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.57 
 
 		 219 aa  41.6  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1550  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  24.81 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.277857 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1210  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  24.62 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.22 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  23.48 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2614  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27 
 
 		 206 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  26.4 
 
 		 188 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.337329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>