24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0797 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0797  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0634  hypothetical protein  87.58 
 
 		 153 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3319  hypothetical protein  87.58 
 
 		 153 aa  254  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.20092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3192  hypothetical protein  80 
 
 		 153 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1391  Redoxin domain protein  23.85 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  23.33 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  23.33 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  24.81 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2137  thiol-disulfide oxidoreductase  24.07 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.213967 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1163  conserved hypothetical protein, possible lipoprotein thioredoxin  30.28 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2135  thiol-disulfide oxidoreductase  24.07 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2245  redoxin domain-containing protein  24.07 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0011  hypothetical protein  28.38 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  27.97 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.19 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  26.45 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  25.62 
 
 		 167 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0011  hypothetical protein  27.7 
 
 		 156 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  27.93 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  25.16 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  31.52 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  25.74 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  27.78 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1328  thiredoxin  22.22 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>