25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3192 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3192  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.745932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3319  hypothetical protein  84.44 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.20092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0634  hypothetical protein  84.44 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0797  hypothetical protein  82.71 
 
 		 153 aa  231  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2114  thioredoxin family protein  25.87 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.14615  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  24.37 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  24.37 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0530  hypothetical protein  24.46 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.473592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.63 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2784  putative thioredoxin-related transmembrane protein  27.97 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.744775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2618  Redoxin domain protein  27.97 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3028  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.12 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  27.52 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4270  hypothetical protein  28.83 
 
 		 331 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000107556  normal  0.839186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  25.55 
 
 		 178 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  25.55 
 
 		 178 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  25.55 
 
 		 194 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  25.55 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  25.55 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  24.05 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08080  Peroxiredoxin  20.18 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000479463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3250  hypothetical protein  25 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  25.55 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  25.55 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  25.83 
 
 		 171 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>