144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1379 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0760  putative suppressor for copper-sensitivity C precursor  68.91 
 
 		 216 aa  290  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  46.22 
 
 		 238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  43.7 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  34.71 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  34.71 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  34.71 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  34.71 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 294 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  34.71 
 
 		 207 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  29.75 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  24.9 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  24.9 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.83 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  25.33 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  23.87 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  24.15 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  23.87 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  25.21 
 
 		 274 aa  72  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  25.89 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  24.32 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  21.03 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  25 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  25 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  22.43 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  24.57 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  22.37 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  25.36 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  22.98 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  24.85 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  25.35 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  23.95 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.16 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  21.15 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  20.71 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  23.03 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  26.28 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  20.09 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  20.7 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.61 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  22.16 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  23.53 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  24.53 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 354 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  24.84 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  24.07 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  23.73 
 
 		 664 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  20 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  23.14 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  23.95 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  23.95 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  22.92 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  20.31 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  23.95 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  24.71 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  24.7 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  22.75 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  21.74 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  22.95 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  27.59 
 
 		 210 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  25 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  21.69 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  21.69 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  21.97 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  21.25 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>