168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001108 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  83.05 
 
 		 238 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  43.7 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0760  putative suppressor for copper-sensitivity C precursor  43.29 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  36.14 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  36.14 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  36.14 
 
 		 207 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  36.14 
 
 		 207 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  35.54 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  36.94 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  28.46 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  28.46 
 
 		 294 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  32.02 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  28.69 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.11 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  27.98 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  28.63 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.61 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  25.36 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  25.36 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  26.99 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  26.99 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 354 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  23.64 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  23.64 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  26.59 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  24.6 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  22.81 
 
 		 306 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  22.51 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  23.75 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  24.52 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  24.08 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  23.36 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  22.59 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  23.21 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  24.9 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  23.61 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  24.47 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  22.67 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  22.43 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  23.24 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  21.7 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 671 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 671 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  23.03 
 
 		 339 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  25.7 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.42 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  23.39 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  24.16 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  22.81 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  21.03 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  25.2 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.71 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  25.93 
 
 		 671 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.71 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  22.16 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  24.67 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  22.55 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.64 
 
 		 255 aa  51.6  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 197 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  21.29 
 
 		 267 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.07 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  23.33 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  27.1 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  23.33 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  23.98 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.07 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>