179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04861 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  83.05 
 
 		 238 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  46.22 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0760  putative suppressor for copper-sensitivity C precursor  43.92 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  33.62 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  35.23 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  35.53 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  34.13 
 
 		 207 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  34.13 
 
 		 207 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  34.13 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  34.13 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  33.53 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  33.85 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  23.27 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 664 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.01 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.11 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  28.22 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  24.49 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  24.69 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  23.46 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 		 339 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  23.71 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  25.61 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  27.86 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  25.55 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  23.89 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  23.53 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  23.9 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  23.9 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 671 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  25.45 
 
 		 671 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 671 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  23.35 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  22.17 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  25.94 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  22.46 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  21.51 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  21.54 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  25.2 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  23.11 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  24.75 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  21.46 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  23.05 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  23.72 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  25.75 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  24.03 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.92 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  23.03 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  23.12 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  23.17 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  25.49 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.07 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.07 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  22.96 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  28.82 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  24.34 
 
 		 293 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  23.92 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1289  glutaredoxin  26.17 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000448477  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  22.63 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3395  protein-disulfide isomerase-like protein  26.75 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>