240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1750 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  90.6 
 
 		 255 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  80 
 
 		 255 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  77.34 
 
 		 254 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  78.9 
 
 		 255 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  75.69 
 
 		 255 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  74.9 
 
 		 255 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  49.43 
 
 		 260 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  55.34 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  48 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  49.78 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  49.15 
 
 		 259 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  49.78 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  46.53 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  46.91 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  44.66 
 
 		 274 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  44.62 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  44.83 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  46.22 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  43.08 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  41.53 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  41.12 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  41.12 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 		 268 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  39.92 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  39.92 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  39.24 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  39.24 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  40.72 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  40.72 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  35.51 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  37.26 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.78 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  34.8 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  36.51 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  34.38 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  38.43 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  35.17 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  38.07 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  39.2 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  33.62 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  38.64 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  34.8 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 209 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  32.27 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  34.52 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  27.73 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.19 
 
 		 211 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  28.85 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  35.15 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  32.16 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  35.75 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.13 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  35.75 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  35.2 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  33.13 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  35.75 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  35.75 
 
 		 207 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 535 aa  98.6  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  30.22 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  34.97 
 
 		 198 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  27.73 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  27.82 
 
 		 294 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 274 aa  92.4  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  27.42 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  29.34 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.92 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  31.48 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>