202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3004 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 263 aa  533  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  63.64 
 
 		 274 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  62.36 
 
 		 294 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  62.36 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  61.98 
 
 		 294 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  61.83 
 
 		 272 aa  325  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  60.57 
 
 		 244 aa  241  9e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  38.1 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  38.1 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  38.1 
 
 		 207 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  38.1 
 
 		 207 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  37.5 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.68 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  35.23 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  36.94 
 
 		 238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  31.67 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  30.45 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  29.02 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  29.54 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  28.04 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  28.04 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  32.44 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.2 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.02 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  28.69 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  26.02 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  27.19 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  27.42 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  30.77 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0760  putative suppressor for copper-sensitivity C precursor  32.26 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.78 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  27.14 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  26.72 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  25.1 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  25.6 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  25.52 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  27.23 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.63 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  26.98 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  30.26 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  27.84 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  27.96 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  26.88 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  25.99 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 211 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 671 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  28.67 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  23.93 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  26.25 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  28.41 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  23.11 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  25.48 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  24.11 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 204 aa  65.1  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  27.11 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  21.43 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  26.36 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  24.55 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>