214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3906 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 273 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  39.22 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  41.26 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  36.55 
 
 		 252 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  35.32 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  38.35 
 
 		 250 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  35.74 
 
 		 260 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  35.41 
 
 		 252 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  39.11 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  37.05 
 
 		 252 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  38.39 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  38.39 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  34.96 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  34.96 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  32.75 
 
 		 252 aa  112  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  33.64 
 
 		 252 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  34.75 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.2 
 
 		 253 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  35.07 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  33 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  33.65 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  35.55 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  29.79 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 255 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  31.96 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  33.15 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  38.3 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  36.69 
 
 		 211 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  34.66 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  35.4 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  36.23 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  25.48 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 197 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  32.73 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  26.1 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  32.73 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  32.73 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  34.19 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  32.12 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  32.12 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  29.52 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  30.23 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.78 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  34.78 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0030  hypothetical protein  31.52 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619375  normal  0.116202 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  24.21 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.16 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.22 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.19 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>