141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0030 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0030  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619375  normal  0.116202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  97.86 
 
 		 281 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  38.43 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  33.46 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  33.46 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  33.83 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  33.83 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 243 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 243 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  26.03 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  26.03 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.35 
 
 		 253 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 247 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  30.4 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  31.28 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  26.5 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  26.69 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  28.91 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  27.15 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  25.98 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  24.51 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  22.55 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  25.99 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  26.26 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  29.41 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  27.55 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  29.01 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  26.67 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0074  dsba oxidoreductase  31.85 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  28.49 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  26.14 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 217 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  23.88 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  26.26 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  26.26 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  26.26 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  24.88 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  26.26 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  26.26 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  22.06 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.61 
 
 		 204 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.61 
 
 		 204 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  26.27 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  21.71 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  22.45 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  23.58 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  23.47 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  36.07 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  23.94 
 
 		 535 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.63 
 
 		 664 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>