256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1733 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  96.43 
 
 
252 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  66.67 
 
 
274 aa  349  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  63.01 
 
 
255 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  56.74 
 
 
265 aa  250  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  56.74 
 
 
265 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  55.88 
 
 
268 aa  245  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  50.41 
 
 
252 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  43.53 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  44.83 
 
 
255 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  44.17 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  41.7 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  44.4 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  45 
 
 
255 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 
259 aa  188  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  45.33 
 
 
254 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
257 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  42.8 
 
 
266 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  38.84 
 
 
257 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  43.27 
 
 
265 aa  185  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  38.77 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  40.87 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  41.85 
 
 
275 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 
260 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 
243 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 
243 aa  169  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  37.55 
 
 
263 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  39.66 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  36.51 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  36.51 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
254 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.08 
 
 
253 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  36.94 
 
 
255 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 
250 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 
247 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 
247 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  36.19 
 
 
247 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  36.58 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  36.58 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  34.56 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  34.65 
 
 
245 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
248 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  36.08 
 
 
209 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  33.9 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 
246 aa  111  9e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  29.13 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 
265 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  35.17 
 
 
211 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  36.3 
 
 
222 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 
269 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  38.65 
 
 
211 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  34.27 
 
 
198 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.37 
 
 
204 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
217 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.37 
 
 
204 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  36.65 
 
 
228 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
205 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
209 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 
197 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  34.71 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  35.14 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
210 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  27.35 
 
 
252 aa  95.5  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  35.93 
 
 
211 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  35.6 
 
 
228 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  26.95 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 
236 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  31.14 
 
 
207 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 
226 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  31.14 
 
 
207 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  31.14 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  31.14 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  30.54 
 
 
207 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  34.46 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  27.15 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
210 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
210 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
235 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 
535 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 
204 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  26.55 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  26.61 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.87 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  22.58 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>