257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1661 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  56.79 
 
 		 260 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  43.61 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  44.73 
 
 		 257 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  49.36 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  43.91 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  47.23 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  48.32 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  42.54 
 
 		 259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  47.03 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  46.38 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  46.64 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  40.43 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  38.52 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  42.62 
 
 		 252 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  41.88 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  45.3 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  40.18 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  46.22 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  38.4 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  38.4 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  41.01 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  40.19 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  37.73 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  34.18 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  34.18 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  38.1 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  32.14 
 
 		 247 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 		 247 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  34.23 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  34.23 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  30.42 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 209 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  30.4 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 		 205 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  31.67 
 
 		 228 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 232 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  28.34 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  32.8 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  31.75 
 
 		 228 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 222 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  31.16 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  32.91 
 
 		 211 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  27.73 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  25.86 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 535 aa  92  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  27.31 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  25.99 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 197 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.93 
 
 		 211 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  33.12 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.29 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.29 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  24.44 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  28.84 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  32.47 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  32.62 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  31.84 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  31.72 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  30.36 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  27.2 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  30 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  30.63 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  30 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  30.43 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  30.43 
 
 		 207 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  25.54 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  21.77 
 
 		 249 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0030  hypothetical protein  27.91 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619375  normal  0.116202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>