273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0730 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  58.67 
 
 		 275 aa  272  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  46.03 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  46.43 
 
 		 257 aa  221  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  44.86 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  42.19 
 
 		 259 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  43.86 
 
 		 259 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  45.93 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  43.42 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  46.12 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  45.02 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  45.69 
 
 		 255 aa  205  7e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  45.69 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  47.41 
 
 		 255 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  47.56 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  44.96 
 
 		 266 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  40.82 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  43.32 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  43.32 
 
 		 265 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  43.51 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  42.11 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 252 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  37.7 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  38.71 
 
 		 247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  34.14 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  34.36 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  35.25 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  35.25 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.36 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  34.58 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  33.63 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  34.96 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  34.51 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  35.16 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  35.16 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  31.08 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  33.06 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  38.42 
 
 		 205 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  37.61 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  31.53 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  30.36 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  33.33 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.04 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.04 
 
 		 204 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 535 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 273 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  29.55 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  26.59 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 246 aa  92  9e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 210 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.42 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  25.3 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  37.04 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  25.2 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  27.24 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  25.1 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  32.32 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  33.57 
 
 		 210 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  25.1 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  32.32 
 
 		 207 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  32.32 
 
 		 207 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  32.32 
 
 		 207 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  31.71 
 
 		 207 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  33.7 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.13 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  30.05 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  28.64 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.5 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>