126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1504 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  93.86 
 
 		 228 aa  440  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  97.37 
 
 		 228 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  67.48 
 
 		 232 aa  278  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  59.9 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  51.74 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  43.12 
 
 		 247 aa  124  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  36.25 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  34.32 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  36.25 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  36.25 
 
 		 259 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  38.95 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  37.79 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  32.78 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  37.21 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  35.6 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  35.67 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 254 aa  98.2  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 		 252 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  37.27 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  33.73 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  35.44 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  35.44 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  30.3 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  25.79 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  30.3 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  32.93 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  28.3 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  30.56 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  30.56 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  27.15 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  27.12 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  23.43 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  26.92 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  22.95 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  28 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.4 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  30.14 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.05 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.05 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  26.71 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  25.31 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  28.39 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0030  hypothetical protein  29.58 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619375  normal  0.116202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.66 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  27.98 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 339 aa  55.1  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 535 aa  54.7  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 354 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 		 348 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  24.14 
 
 		 349 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  26.29 
 
 		 671 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 		 664 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  22.92 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  22.92 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 671 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  26.86 
 
 		 671 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  22.92 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  22.92 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  22.92 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  27.46 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  23.45 
 
 		 349 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  23.18 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  28.74 
 
 		 390 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>