More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3648 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
339 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.44 
 
 
335 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.54 
 
 
349 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.23 
 
 
349 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
348 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 
240 aa  136  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  38.25 
 
 
247 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  36.11 
 
 
268 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  38.69 
 
 
242 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 
671 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 
671 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.04 
 
 
265 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  40.23 
 
 
671 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 
263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  42.57 
 
 
553 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 
664 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  32.06 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  35.08 
 
 
265 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  38.15 
 
 
214 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  42.17 
 
 
876 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  37.65 
 
 
263 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  41.89 
 
 
228 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  32.59 
 
 
262 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
221 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  38.69 
 
 
253 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 
230 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  36.94 
 
 
624 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.52 
 
 
270 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  40.28 
 
 
173 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  39.41 
 
 
231 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 
182 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 
273 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 
296 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 
267 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 
276 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 
220 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  42.65 
 
 
600 aa  99.4  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
182 aa  99.4  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 
179 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  30.16 
 
 
288 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  32.4 
 
 
236 aa  95.9  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  37.18 
 
 
249 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
232 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 
307 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  39.22 
 
 
311 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
276 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  37.68 
 
 
196 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 
251 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
241 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  38.85 
 
 
616 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  34.12 
 
 
226 aa  90.1  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
250 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
281 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 
254 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 
311 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 
311 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
255 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
251 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 
241 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.13 
 
 
275 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  33.89 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  36.81 
 
 
182 aa  85.9  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  35.71 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 
219 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.28 
 
 
224 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 
299 aa  84  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  35.71 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  34.75 
 
 
613 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  34.75 
 
 
613 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  34.75 
 
 
613 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  37.41 
 
 
652 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  34.93 
 
 
624 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  33.14 
 
 
218 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 
172 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
224 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  35.21 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  36.55 
 
 
630 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.14 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0426  protein-disulfide isomerase-like protein  29.21 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  32.75 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  36.17 
 
 
617 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  35.92 
 
 
627 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  36.69 
 
 
652 aa  79.3  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>