294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0515 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 269 aa  522  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.2 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 		 255 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  32.33 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  31.17 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  31.17 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  35.36 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  32.59 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 252 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  31.42 
 
 		 255 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  31.56 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  34.4 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  34.35 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  31.66 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  34.84 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  29.03 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  29.03 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  36.2 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  30.7 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  33.79 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  35.58 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  28.31 
 
 		 274 aa  95.5  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 211 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  30.45 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 209 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 		 211 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  33.96 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 270 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 211 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  29.37 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  34.13 
 
 		 198 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  21.86 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  32.43 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  30.17 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  26.89 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  26.89 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  26.89 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  26.89 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.71 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.71 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  26.47 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  23.94 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  28.87 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  28.63 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  23.47 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 671 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 281 aa  62  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.22 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>