More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2172 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  68.42 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  51.55 
 
 		 270 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  50.58 
 
 		 276 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  34.47 
 
 		 335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.88 
 
 		 349 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 349 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  27.2 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  41.67 
 
 		 876 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  36.69 
 
 		 671 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  36.75 
 
 		 671 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 354 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  36.75 
 
 		 671 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  38.18 
 
 		 182 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.56 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 664 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  34.03 
 
 		 624 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  34.72 
 
 		 600 aa  89.7  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  36.13 
 
 		 616 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 260 aa  88.6  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.43 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  25.56 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  27.2 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.1 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  32.2 
 
 		 652 aa  82  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  33.93 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  33.33 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.06 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  29.25 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  29.25 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.71 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.93 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  27.6 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 173 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  30.47 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  32.48 
 
 		 617 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  31.48 
 
 		 553 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  25.57 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  34.87 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  29.08 
 
 		 630 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  25.3 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  25.3 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  27.2 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  26.75 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  23.87 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  31.36 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  26.34 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  31.87 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  27.03 
 
 		 613 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  27.03 
 
 		 613 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  27.03 
 
 		 613 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  30.86 
 
 		 617 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.76 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  25.78 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  24.12 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  23.14 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>